Search for: [Abstrakt = "Dysertacja jest poświęcona syntezie nowych kowalencyjnych inhibitorów gingipain. Gingipainy są proteazami cysteinowymi izolowanymi z bakterii P. gingivalis uznanymi za najistotniejsze czynniki etiologiczne w powstawaniu paradontozy. W oparciu o strukturę krystaliczną kompleksu gingipainy R2 z inhibitorem D\-Phe\-Phe\-Arg\-CH2Cl zaprojektowano nowe ligandy zawierające w strukturze resztę P2 komplementarną do wnęki wiążącej S2 enzymu używając metod symulacyjnych. Wykorzystując oprogramowanie do projektowania w oparciu o homologię docelowych enzymów zaproponowano model 3D gingipainy K \(Kgp\), której struktura krystaliczna do tej pory nie jest znana. Model ten użyto do projektowania ligandów Kgp. Analiza zależności struktura\-aktywność dla najaktywniejszych sposród zsyntezowanych chlorometyloketonów umożliwiła zaplanowanie budowy mniej reaktywnych \(bardziej selektywnych\) inhibitorów z grupy akceptorów Michael'a i oksiranów, dla których opracowano dogodne metody syntezy."]